Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl40Q9D783 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms