Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec23bQ9D662 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms