Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc39Q9D5Y1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms