Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm3404Q9D506 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3404Q9D506 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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