Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms