Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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OxsmQ9D404 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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OxsmQ9D404 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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OxsmQ9D404 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
OxsmQ9D404 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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OxsmQ9D404 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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OxsmQ9D404 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OxsmQ9D404 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms