Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx29Q9D3S3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx29Q9D3S3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms