Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms