Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trappc6bQ9D289 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc6bQ9D289 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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