Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms