Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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