Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms