Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc47Q9D024 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms