Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf146Q9CZW6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf146Q9CZW6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms