Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Shmt2Q9CZN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms