Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsfl1cQ9CZ44 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms