Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl11Q9CXW4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms