Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pin4Q9CWW6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms