Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prkrip1Q9CWV6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms