Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Malsu1Q9CWV0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms