Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms