Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms