Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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