Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl17Q9CPR4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms