Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cntnap4Q99P47 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntnap4Q99P47 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntnap4Q99P47 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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