Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsnaxip1Q99P25 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms