Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms