Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms