Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hdac9Q99N13 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hdac9Q99N13 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Hdac9Q99N13 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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