Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo2Q99LG2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms