Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TrabdQ99JY4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TrabdQ99JY4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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