Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sfxn1Q99JR1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sfxn1Q99JR1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sfxn1Q99JR1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sfxn1Q99JR1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sfxn1Q99JR1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sfxn1Q99JR1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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