Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms