Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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