Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim7Q923T7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms