Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms