Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Afg3l1Q920A7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Afg3l1Q920A7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms