Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms