Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms