Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C0

Mcmbp, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
McmbpQ8R3C0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
McmbpQ8R3C0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms