Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nup58Q8R332 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup58Q8R332 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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