Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms