Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b4Q8QZY9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms