Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms