Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prpf39Q8K2Z2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms