Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud6bQ8K2H2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms