Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scara5Q8K299 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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