Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c1Q8K284 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms