Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Abcf3Q8K268 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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