Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Polr1eQ8K202 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Polr1eQ8K202 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Polr1eQ8K202 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Polr1eQ8K202 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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